在您设定的这个玄幻世界中，灵石、金币、银币和铜币之间的兑换比例为1:100:1000:，且灵石具有修炼属性，而凡人的金币、银币和铜币则没有。这种经济体系在上层剥削不断加剧、生产力提高而下层灵石越来越少的背景下，可能会导致以下经济自然发展的趋势：

###1.**贫富差距加大**

-**上层的财富积累**：上层通过剥削下层，积累大量灵石和财富。随着生产力的提高，上层可能会利用技术和资源优势，进一步增强对下层的剥削，导致财富集中在少数人手中。

-**下层的困境**：下层由于灵石的稀缺，生活水平下降，无法享受到生产力提高带来的好处。贫富差距的扩大可能导致社会的紧张和不满情绪。

###2.**消费能力下降**

-**生活成本上升**：由于灵石的稀缺，下层可能面临更高的生活成本，尤其是在与修炼相关的商品和服务上。虽然生产力提高，但下层的实际收入（以灵石计）却在减少，导致消费能力下降。

-**市场萎缩**：下层的消费能力下降，市场需求减少，导致一些行业萎缩，影响经济整体活力。

###3.**社会动荡与不满**

-**抗议与反抗**：随着生活条件的恶化和上层剥削的加剧，下层可能会组织抗议或反抗活动，寻求改变现状。这种社会动荡可能会影响经济的稳定性。

-**意识形态的对立**：下层可能会形成反抗上层的意识形态，强调公平与正义，进而推动社会变革的需求。

###4.**黑市与地下经济**

-**灵石黑市**：由于灵石的稀缺，可能会出现黑市交易，凡人为了获得灵石，可能会参与非法活动。这种地下经济可能会对合法经济造成冲击。

-**替代交易方式**：在灵石稀缺的情况下，可能会出现其他形式的交易媒介或替代品，以适应市场需求。